29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5452 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  75.19 
 
 		 267 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  74.81 
 
 		 267 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  81.22 
 
 		 270 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  33.83 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.12 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.22 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.33 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.33 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 356 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 346 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  31.95 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  28.37 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  29.87 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  27.63 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  37.59 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  28.68 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  31.28 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  26.51 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  30.52 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>