30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1480 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.73 
 
 
273 aa  287  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.8 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 
311 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 
344 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.3 
 
 
299 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.2 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.2 
 
 
346 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.55 
 
 
356 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.55 
 
 
346 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  38.25 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  38.22 
 
 
268 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  39.73 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  34.93 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  35.34 
 
 
271 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  36.74 
 
 
275 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  36.79 
 
 
275 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  36.28 
 
 
275 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  33.19 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  32.9 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  32.47 
 
 
267 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  30.6 
 
 
292 aa  85.5  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  35.71 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  32.35 
 
 
316 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  55.56 
 
 
61 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>