23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3194 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  126  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  86.36 
 
 		 268 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  81.82 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  54.35 
 
 		 264 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  60 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  83.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  84.85 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  82.86 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.59 
 
 		 344 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  64.71 
 
 		 312 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  67.74 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 346 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  64.52 
 
 		 346 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  61.29 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>