30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0596 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  71.31 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0326  putative lipoprotein  70.97 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4144  hypothetical protein  70.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1570  hypothetical protein  70.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4796  hypothetical protein  70.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3372  hypothetical protein  70.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6261  hypothetical protein  70.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6737  hypothetical protein  70.46 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  62.5 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2884  hypothetical protein  69.2 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3306  hypothetical protein  69.2 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200987  decreased coverage  0.00359996 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.32 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  38.25 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 344 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.17 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.53 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.13 
 
 		 356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.53 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0637  hypothetical protein  63.51 
 
 		 105 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  29.66 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  28.94 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3194  hypothetical protein  86.11 
 
 		 61 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  26.14 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04286  hypothetical protein  33.09 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>