16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3532 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3532  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1480  hypothetical protein  31.08 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0804  hypothetical protein  30.53 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.777437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0875  hypothetical protein  31.56 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2037  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5452  hypothetical protein  31.89 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0051  peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.26 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6117  peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.83 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.64 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3636  hypothetical protein  31.33 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3710  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632344  normal  0.255786 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.27 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1720  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000550451  unclonable  0.000000249022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5149  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>