117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0669 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  954    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.62 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.27 
 
 		 1012 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  52 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3079  hypothetical protein  36.08 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0517526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  42.65 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  43.55 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  43.55 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.3 
 
 		 1557 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 573 aa  53.5  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  49.06 
 
 		 242 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  47.46 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.66 
 
 		 77 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  31.58 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  38.03 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.8 
 
 		 250 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  30.67 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  32.1 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  47.06 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  44.9 
 
 		 283 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 635 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  35.71 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0052  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 344 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  42.31 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  41.51 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  41.38 
 
 		 234 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  40.68 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 1226 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  40.62 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  40.74 
 
 		 228 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  34.52 
 
 		 395 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 321 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  37.1 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3093  lytic murein transglycosylase  45.61 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.666163  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  42.11 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  44 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  35.09 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  39.62 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 239 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  38.89 
 
 		 409 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  43.64 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  44.83 
 
 		 419 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  37.1 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  40.38 
 
 		 438 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  44 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  32.35 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  31 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1023  hypothetical protein  29.36 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  37.88 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.36 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  40.38 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  44.12 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.67 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  32 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  44 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  38.33 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  36.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  39.06 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0024  lytic murein transglycosylase  45.1 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  32.1 
 
 		 229 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 279 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.28 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  38.89 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 		 1196 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  34.85 
 
 		 232 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  44 
 
 		 913 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 381 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 1261 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  33.82 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  44 
 
 		 978 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.67 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>