27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1197 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  100 
 
 		 946 aa  1918    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0625  hypothetical protein  47.16 
 
 		 919 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.321269  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1936  hypothetical protein  46.78 
 
 		 927 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  32.88 
 
 		 424 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.87 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  35.8 
 
 		 267 aa  115  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.12 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  32.66 
 
 		 276 aa  107  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  32.68 
 
 		 457 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  33.01 
 
 		 450 aa  104  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  37.79 
 
 		 268 aa  103  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 266 aa  102  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  33.71 
 
 		 250 aa  101  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.18 
 
 		 268 aa  92.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  29.65 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  28.79 
 
 		 294 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.14 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.94 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  29.1 
 
 		 258 aa  64.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  30.93 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  27.13 
 
 		 203 aa  60.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  26.14 
 
 		 277 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  30.11 
 
 		 404 aa  54.7  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  26.44 
 
 		 188 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>