26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3855 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3855  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 398 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2250  Lytic transglycosylase catalytic  35.94 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.75 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2350  hypothetical protein  34.36 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.72 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1343  hypothetical protein  39.9 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  36.27 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1239  hypothetical protein  34.38 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1931  putative phage-related protein (hydrolase)  37.57 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.27 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.5 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6577  hypothetical protein  36.78 
 
 		 404 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4256  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3197  putative phage-related protein (hydrolase)  33.51 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000132764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0588  hypothetical protein  35.45 
 
 		 188 aa  89  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.255449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0080  hypothetical protein  33.73 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0578  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  28.5 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1197  DNA-directed RNA polymerase beta' chain  26.14 
 
 		 946 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0957323  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6107  hypothetical protein  28.99 
 
 		 450 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.724115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4199  SH3, type 3  28.22 
 
 		 459 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1931  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>