33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0894 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 457 aa  918    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.1 
 
 		 430 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4048  hypothetical protein  35.38 
 
 		 479 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.422059  normal  0.0578992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0529  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.13 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1880  hypothetical protein  33.89 
 
 		 519 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1255  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 498 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.581168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 589 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  42.86 
 
 		 593 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  47.92 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 596 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  43.08 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  47.92 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  44.64 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 585 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  47.92 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 573 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 244 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 1557 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  44.68 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  39.19 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 346 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.74 
 
 		 1260 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  39.19 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  46.81 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  44.44 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 1226 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  46.81 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 346 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 1196 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>