21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0529 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1880  hypothetical protein  99.61 
 
 
519 aa  1016    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0529  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
519 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1255  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 
498 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.581168 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4048  hypothetical protein  34.02 
 
 
479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.422059  normal  0.0578992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.46 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.17 
 
 
430 aa  161  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 
486 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.87 
 
 
596 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.36 
 
 
585 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 
1557 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 
589 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  40 
 
 
913 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.13 
 
 
1226 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  40 
 
 
978 aa  47.8  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.16 
 
 
573 aa  47.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.96 
 
 
1260 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 
443 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  43.48 
 
 
412 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.91 
 
 
1196 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 
1012 aa  43.5  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  43.48 
 
 
396 aa  43.5  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>