230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0641 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  76.94 
 
 		 593 aa  851    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 589 aa  1152    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  77.1 
 
 		 593 aa  851    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  49.12 
 
 		 576 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.48 
 
 		 596 aa  475  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 		 585 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0537  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.76 
 
 		 513 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  33.17 
 
 		 855 aa  87  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.22 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.05 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.63 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.75 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.08 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.89 
 
 		 448 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  23.62 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  30.99 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.66 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.02 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.96 
 
 		 457 aa  57  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  29.79 
 
 		 387 aa  55.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.69 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  29.08 
 
 		 402 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  29.08 
 
 		 402 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  29.11 
 
 		 382 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1260  hypothetical protein  33.54 
 
 		 242 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  29.08 
 
 		 388 aa  53.9  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  29.79 
 
 		 402 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  28.12 
 
 		 424 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  24.02 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  26.32 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  29.14 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.63 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  29.08 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  29.08 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  29.08 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  26.79 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  31.18 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  31.58 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  29.08 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  23.66 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.71 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.4 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 401 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 401 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 401 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  29.08 
 
 		 401 aa  53.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  29.08 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  29.08 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  29.08 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  29.08 
 
 		 402 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 		 387 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0401  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.63 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039914  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  28.65 
 
 		 411 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  25.71 
 
 		 403 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  29.68 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.26 
 
 		 398 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  29.08 
 
 		 398 aa  51.2  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  26.29 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  29.17 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  26.58 
 
 		 420 aa  50.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 		 384 aa  51.2  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  27.95 
 
 		 502 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.89 
 
 		 307 aa  50.8  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.71 
 
 		 398 aa  50.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 		 380 aa  50.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  23.12 
 
 		 386 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  28.48 
 
 		 379 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.03 
 
 		 307 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.06 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  24.73 
 
 		 380 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24 
 
 		 396 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  28.65 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  32.21 
 
 		 509 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  23.81 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1880  hypothetical protein  35.14 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  29.94 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.95 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.7 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  30 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  29.67 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  23.12 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  27.75 
 
 		 369 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.66 
 
 		 388 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 364 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  28.72 
 
 		 384 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  29.2 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  26.8 
 
 		 362 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0529  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 519 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>