13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1255 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1255  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 498 aa  984    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.581168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1880  hypothetical protein  32.08 
 
 		 519 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0529  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4048  hypothetical protein  34.53 
 
 		 479 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.422059  normal  0.0578992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.54 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.49 
 
 		 430 aa  143  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  48 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  43.33 
 
 		 395 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.33 
 
 		 433 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>