18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2852 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2852  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3574  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  67.32 
 
 		 380 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.68 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.09 
 
 		 954 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  42.11 
 
 		 292 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  41.82 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 266 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  30.84 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 266 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.62 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  34.48 
 
 		 462 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  29.51 
 
 		 2277 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2053  Chitosanase  24.53 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>