37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0765 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  58.33 
 
 
242 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  54.81 
 
 
246 aa  262  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  42.86 
 
 
143 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  42.86 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  36.25 
 
 
149 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  41.25 
 
 
236 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  31.82 
 
 
224 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2310  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.54 
 
 
221 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  41.18 
 
 
438 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.16 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 
329 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 
554 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  32.32 
 
 
146 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  38.04 
 
 
162 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  41.67 
 
 
143 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.43 
 
 
464 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  42.03 
 
 
450 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 
413 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.57 
 
 
433 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  40.32 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  32.58 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  45.45 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.75 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3610  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.38 
 
 
155 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108072  normal  0.729996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  40.32 
 
 
124 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  37.84 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 
393 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  38.71 
 
 
124 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  38.24 
 
 
438 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  35.37 
 
 
454 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  42.19 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  35.24 
 
 
418 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  41.18 
 
 
462 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  34.91 
 
 
413 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
1089 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>