41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4060 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  41.88 
 
 		 143 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  46.46 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  42.28 
 
 		 146 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  42.19 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  39.37 
 
 		 143 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  40.16 
 
 		 143 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  40.32 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  38.89 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  33.9 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  39.64 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  33.33 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  34.19 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.7 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  37.04 
 
 		 459 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  35.8 
 
 		 421 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.25 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  34.57 
 
 		 426 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6049  hypothetical protein  37.66 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  48 
 
 		 124 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  47.83 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  47.83 
 
 		 124 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  36.23 
 
 		 347 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  39.34 
 
 		 513 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  30.9 
 
 		 540 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  39.29 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  37.35 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  45.65 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1289  hypothetical protein  39.39 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.0554205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  28.47 
 
 		 1050 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  35 
 
 		 529 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  45 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  37.1 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  28.92 
 
 		 110 aa  43.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  34.18 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  35 
 
 		 589 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1740  hypothetical protein  34.85 
 
 		 205 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  31.87 
 
 		 541 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.346542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>