115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1427 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1066    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  80.48 
 
 		 589 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  65.12 
 
 		 540 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  61.76 
 
 		 541 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  62.89 
 
 		 526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  54.22 
 
 		 544 aa  548  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  56.93 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  54.72 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2874  protein of unknown function DUF882  51.45 
 
 		 502 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  41.4 
 
 		 608 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  46.42 
 
 		 598 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  53.26 
 
 		 499 aa  280  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  45.57 
 
 		 636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2751  hypothetical protein  50.98 
 
 		 496 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  46.42 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0216  protein of unknown function DUF882  56.28 
 
 		 510 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2978  protein of unknown function DUF882  53.78 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  46.58 
 
 		 659 aa  267  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  50.63 
 
 		 637 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  44.21 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  50.83 
 
 		 659 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  57.35 
 
 		 625 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  46.97 
 
 		 497 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  48.38 
 
 		 452 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  53.28 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  51.97 
 
 		 635 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  48.98 
 
 		 182 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  48.98 
 
 		 182 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  48.98 
 
 		 182 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  48.98 
 
 		 182 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  48.98 
 
 		 182 aa  143  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  48.3 
 
 		 182 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  47.62 
 
 		 182 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  47.62 
 
 		 182 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  47.62 
 
 		 182 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  46.31 
 
 		 179 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  43.6 
 
 		 182 aa  140  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  47.62 
 
 		 182 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  47.33 
 
 		 203 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  42.69 
 
 		 182 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  45 
 
 		 183 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  40.23 
 
 		 183 aa  137  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  46.26 
 
 		 183 aa  136  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  48.03 
 
 		 187 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  45.27 
 
 		 163 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  46.26 
 
 		 182 aa  135  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  46.26 
 
 		 182 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  46.26 
 
 		 182 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  46.26 
 
 		 182 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  46.26 
 
 		 182 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  44.9 
 
 		 182 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  46.79 
 
 		 205 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  45.58 
 
 		 182 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  44.97 
 
 		 186 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  45.58 
 
 		 182 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  44.22 
 
 		 225 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  46.98 
 
 		 184 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  45.58 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  43.54 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  43.54 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  43.54 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  43.54 
 
 		 182 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  42.28 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  47.37 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  43.54 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  44.9 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  39.16 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  44.22 
 
 		 183 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  44.22 
 
 		 182 aa  127  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  43.54 
 
 		 169 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  42.86 
 
 		 195 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  45.64 
 
 		 190 aa  124  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  42.76 
 
 		 212 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  44.97 
 
 		 190 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  42.76 
 
 		 188 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  43.42 
 
 		 188 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  42.47 
 
 		 186 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  44.67 
 
 		 178 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  43.84 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  42.76 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  42.04 
 
 		 190 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  40.88 
 
 		 187 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  40.12 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 185 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  42.28 
 
 		 187 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  39.33 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  39.33 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  39.46 
 
 		 186 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  37.14 
 
 		 229 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1799  protein of unknown function DUF882  45.89 
 
 		 187 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  36 
 
 		 194 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>