19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2171 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  100 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  46.46 
 
 		 236 aa  88.6  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  40.79 
 
 		 146 aa  84.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  39.6 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  34.55 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  40.41 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  38.26 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  36.91 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  38.41 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  40.18 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  35.11 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  33.59 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6049  hypothetical protein  38.71 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1740  hypothetical protein  37.1 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540445 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  31.21 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1289  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.0554205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  34.78 
 
 		 1050 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2115  Peptidase M15A  29.22 
 
 		 358 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.759128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>