28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3367 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  339  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  44.12 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  42.03 
 
 		 143 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  39.86 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  40 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  39.86 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  42.62 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  36.89 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  38.3 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  36.36 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  30.87 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  28.29 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  36.25 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  27.2 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.68 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  32.5 
 
 		 124 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  34.57 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  32.5 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 246 aa  44.7  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6049  hypothetical protein  27.59 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1740  hypothetical protein  36.51 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540445 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  37.36 
 
 		 355 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  32.29 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  39.58 
 
 		 459 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  31.25 
 
 		 102 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.1 
 
 		 263 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>