32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2260 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  47.06 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  42.34 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  40.13 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  40.13 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  40.58 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  42.19 
 
 		 236 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  39.22 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  39.83 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  38.3 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  29.37 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  36.17 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  35.11 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  27.97 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  30.48 
 
 		 513 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  34.09 
 
 		 124 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  47.06 
 
 		 124 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 246 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.04 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0730  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.856878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.76 
 
 		 242 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  50 
 
 		 124 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0730  peptidase M15A  34.55 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.0731451 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  35.24 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  31 
 
 		 355 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 400 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  48.94 
 
 		 127 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1305  hypothetical protein  30.68 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  37.7 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>