29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1672 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  100 
 
 
146 aa  303  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  52.78 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  44.6 
 
 
149 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  39.86 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  39.86 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  36.5 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  42.62 
 
 
165 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  36.5 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  39.64 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  39.83 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  31.11 
 
 
157 aa  52  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  40.18 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  45.76 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50 
 
 
242 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  37.5 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  37.5 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  36.56 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  36.26 
 
 
355 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  36.54 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  34.78 
 
 
246 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.45 
 
 
263 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  47.92 
 
 
341 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  27.73 
 
 
192 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  41.3 
 
 
421 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  29.2 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  35.71 
 
 
110 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  36.54 
 
 
426 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  45.65 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2082  hypothetical protein  27.62 
 
 
196 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>