13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3619 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  34.55 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  33.54 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  31.71 
 
 
143 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  34.19 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  31.71 
 
 
143 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  28.29 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  30.49 
 
 
143 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  27.97 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  30.43 
 
 
1050 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  29.2 
 
 
146 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  29.2 
 
 
146 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>