118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0511 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  100 
 
 		 124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  72.22 
 
 		 80 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  44.54 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  44.54 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  44.54 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  42.55 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  42.55 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  39.62 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  35.9 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  39.78 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  39.78 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0545  hypothetical protein  58.33 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  35.45 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  34.55 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  40.62 
 
 		 421 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  41.67 
 
 		 426 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  46.91 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  34.58 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  39.36 
 
 		 341 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4302  hypothetical protein  40.74 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.315098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  41.94 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  41.77 
 
 		 212 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  41.05 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  41.77 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  41.27 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  38.95 
 
 		 203 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  34.78 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  38.55 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  38.28 
 
 		 1050 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  44.83 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  42.62 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  37.23 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  42.17 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 		 183 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  35 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  45.76 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  38.64 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  37.97 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  36.46 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  36.78 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  36.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  35.53 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  35.56 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  38.1 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  31.13 
 
 		 355 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  38.16 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  48 
 
 		 236 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  34.15 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.08 
 
 		 242 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2892  hypothetical protein  26.54 
 
 		 312 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535809  hitchhiker  0.00714521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  33.68 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  33.68 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5363  hypothetical protein  32.05 
 
 		 234 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0595161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  32.95 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  36.62 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  37.33 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  34.07 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  36.84 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  31.25 
 
 		 513 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  34.25 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  36.71 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  38.24 
 
 		 225 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.58 
 
 		 263 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  50 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  36.56 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  31.65 
 
 		 625 aa  43.5  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  35.23 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  34.34 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  34.15 
 
 		 659 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  32.91 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0730  peptidase M15A  36.26 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.0731451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  34.34 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  37.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  37.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  37.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  37.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  37.84 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  37.84 
 
 		 182 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  37.84 
 
 		 182 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  35.29 
 
 		 195 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  34.72 
 
 		 192 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  32.91 
 
 		 497 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  30 
 
 		 589 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 182 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>