47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6567 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  100 
 
 		 513 aa  1055    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  51.4 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.35 
 
 		 531 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2010  hypothetical protein  43.5 
 
 		 270 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0624267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2481  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0485388  normal  0.126886 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5958  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.36 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207674  decreased coverage  0.00749937 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  43.28 
 
 		 341 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.59 
 
 		 393 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5766  hypothetical protein  37.35 
 
 		 211 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.496747  normal  0.481702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  43.37 
 
 		 179 aa  54.3  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1785  hypothetical protein  32.43 
 
 		 274 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  39.39 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  37.5 
 
 		 189 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  33.96 
 
 		 149 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  41.46 
 
 		 540 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  31.96 
 
 		 162 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  37.11 
 
 		 190 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  36.27 
 
 		 169 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  32.39 
 
 		 212 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  40 
 
 		 541 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  38.14 
 
 		 421 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  30.89 
 
 		 143 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  28.43 
 
 		 143 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  30.89 
 
 		 143 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1484  peptidase M15A  30.91 
 
 		 313 aa  47.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  43.04 
 
 		 184 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  38.46 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  37.11 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  39.34 
 
 		 236 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  27.87 
 
 		 124 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  31.37 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  42.5 
 
 		 608 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  38.75 
 
 		 529 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  31.25 
 
 		 124 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  39.29 
 
 		 497 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  38.2 
 
 		 526 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0930  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.581759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  38.75 
 
 		 589 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  35 
 
 		 179 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  41.77 
 
 		 458 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  39.51 
 
 		 452 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  39.08 
 
 		 659 aa  43.9  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  33 
 
 		 182 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>