123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1277 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  873    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  72.26 
 
 		 421 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  37.27 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  62.9 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  33.86 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  58.87 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  37.62 
 
 		 124 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0028  Peptidase M15A  51.95 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  41.67 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  40.95 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  35.83 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  39.22 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  36.63 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  36.63 
 
 		 124 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  40.45 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  40 
 
 		 190 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  41.88 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  46.91 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0040  Peptidase M15A  48.05 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  41.46 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  41.46 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  41.46 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  41.46 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  41.46 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  39.02 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  40.24 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  34.31 
 
 		 256 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  39.24 
 
 		 183 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  40.51 
 
 		 182 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  38.83 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  45.68 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  38.39 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  38.75 
 
 		 183 aa  57  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  39.64 
 
 		 187 aa  57  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  42.86 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 		 187 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  38.74 
 
 		 540 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  38.27 
 
 		 625 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  43.75 
 
 		 185 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  37.14 
 
 		 526 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  37 
 
 		 186 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  37.5 
 
 		 182 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  41.25 
 
 		 186 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  33.98 
 
 		 182 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5363  hypothetical protein  30.6 
 
 		 234 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0595161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  34 
 
 		 182 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  38.46 
 
 		 186 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  34.58 
 
 		 188 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  39.51 
 
 		 182 aa  53.9  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  41.67 
 
 		 589 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  41.67 
 
 		 529 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  34 
 
 		 182 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  38.55 
 
 		 182 aa  53.1  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  41.77 
 
 		 169 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  40.51 
 
 		 195 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  38.1 
 
 		 529 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  32.73 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  38.55 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  43.04 
 
 		 163 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  38.27 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  38.27 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  38.27 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  35.8 
 
 		 659 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  37.7 
 
 		 129 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  39.24 
 
 		 187 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  32.71 
 
 		 186 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  32.73 
 
 		 188 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  34.23 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  41.82 
 
 		 143 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  40.51 
 
 		 186 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  37.04 
 
 		 182 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  33.66 
 
 		 212 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  40.51 
 
 		 183 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4302  hypothetical protein  40.79 
 
 		 180 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.315098 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  30.61 
 
 		 127 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  41.77 
 
 		 182 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  41.77 
 
 		 182 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  41.77 
 
 		 182 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  37.37 
 
 		 186 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  42.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  41.77 
 
 		 182 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  40.96 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  33.65 
 
 		 179 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  40.96 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  39.02 
 
 		 502 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  40.96 
 
 		 205 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>