124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2110 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  93.96 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  93.96 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  93.96 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  87.91 
 
 		 182 aa  339  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  87.91 
 
 		 182 aa  338  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  87.91 
 
 		 182 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  87.91 
 
 		 182 aa  338  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  89.01 
 
 		 182 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  71.98 
 
 		 182 aa  287  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  73.08 
 
 		 182 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  69.23 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  67.58 
 
 		 183 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  72.39 
 
 		 163 aa  260  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  68.42 
 
 		 171 aa  254  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  69.33 
 
 		 163 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  51.41 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  51.41 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  51.41 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  51.41 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  51.41 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  51.7 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  50.85 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  48.88 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  50.61 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  48.59 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  49.43 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  48 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  48 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  48 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  47.43 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  47.43 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  46.86 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  48.9 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  46.29 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  46.86 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  47.19 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  46.86 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  45.9 
 
 		 187 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  47.3 
 
 		 502 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  48.59 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  47.3 
 
 		 497 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  47.62 
 
 		 540 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  50.68 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  46.62 
 
 		 541 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  44.13 
 
 		 637 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  47.62 
 
 		 529 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  42.86 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  44.13 
 
 		 659 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  47.47 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  44.19 
 
 		 608 aa  138  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  46.43 
 
 		 452 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  40.33 
 
 		 659 aa  137  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  41.62 
 
 		 203 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  46.94 
 
 		 589 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  45.83 
 
 		 458 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  41.8 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  44.52 
 
 		 189 aa  134  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  40.49 
 
 		 625 aa  134  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  45.81 
 
 		 635 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  42.41 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  41.01 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  44.87 
 
 		 636 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  48.97 
 
 		 225 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  45.33 
 
 		 544 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  46 
 
 		 526 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  46 
 
 		 529 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2978  protein of unknown function DUF882  41.89 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2751  hypothetical protein  41.89 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2874  protein of unknown function DUF882  41.22 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  44.23 
 
 		 597 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  37.29 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  46.71 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  39.74 
 
 		 188 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  42.61 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  43.59 
 
 		 598 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  40 
 
 		 499 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  45.21 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  45.21 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  45.58 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  39.07 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  45.21 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  39.04 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  41.1 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  42.07 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  39.19 
 
 		 501 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0216  protein of unknown function DUF882  39.19 
 
 		 510 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1799  protein of unknown function DUF882  41.67 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  36.49 
 
 		 194 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>