131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5086 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  53.53 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4302  hypothetical protein  49.17 
 
 		 180 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.315098 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5363  hypothetical protein  39.66 
 
 		 234 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0595161 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  47.58 
 
 		 234 aa  117  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  30.81 
 
 		 179 aa  115  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  38.25 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  34.21 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  34.97 
 
 		 182 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  36.81 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  40.96 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  37.14 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  30.77 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  37.09 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  38.33 
 
 		 452 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  39.6 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  37.91 
 
 		 458 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  35.57 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  35.14 
 
 		 659 aa  99.8  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  34.05 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  39.6 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  36.49 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  38.26 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  38.26 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  32.66 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  35.46 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  36.49 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  33.77 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  36.81 
 
 		 637 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  36.81 
 
 		 659 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  33.11 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.6 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.6 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.6 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  32.6 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  32.6 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  37.84 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  37.84 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  37.84 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  34.44 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  36.49 
 
 		 163 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  34.44 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  34.44 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  36.67 
 
 		 497 aa  94.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  36.67 
 
 		 589 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  35 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  36.18 
 
 		 544 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  38 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  36.49 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  33.99 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  37.16 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  38 
 
 		 608 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  33.11 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  33.78 
 
 		 625 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  30.98 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  37.09 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  36.84 
 
 		 636 aa  91.7  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  36 
 
 		 529 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  36 
 
 		 502 aa  91.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  30.39 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  32 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  36.67 
 
 		 540 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  36.84 
 
 		 598 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  44.3 
 
 		 212 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  34.55 
 
 		 597 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  32.43 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  32.67 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  32.24 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  32.24 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  32.24 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  33.33 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  35.81 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  36.3 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2874  protein of unknown function DUF882  34.21 
 
 		 502 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  34.87 
 
 		 526 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  30.85 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2751  hypothetical protein  33.55 
 
 		 496 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  35.33 
 
 		 499 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2978  protein of unknown function DUF882  33.55 
 
 		 496 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  34.67 
 
 		 541 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  31.02 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  36 
 
 		 635 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  34.21 
 
 		 529 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  33.55 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  34.05 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0216  protein of unknown function DUF882  32.89 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  34.23 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>