114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4190 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  100 
 
 
256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  46.61 
 
 
637 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  46.61 
 
 
659 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  43.59 
 
 
635 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  34.84 
 
 
186 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  44.17 
 
 
636 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  45.38 
 
 
452 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  45.38 
 
 
458 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  43.22 
 
 
608 aa  99  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  35.15 
 
 
183 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  44.17 
 
 
597 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  43.33 
 
 
598 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 
187 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  43.22 
 
 
182 aa  95.1  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  41.32 
 
 
499 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  40.34 
 
 
659 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  39.5 
 
 
187 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  41.46 
 
 
163 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0216  protein of unknown function DUF882  42.74 
 
 
510 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  35.15 
 
 
182 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  40.35 
 
 
189 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  41.53 
 
 
497 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  42.15 
 
 
541 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  43.1 
 
 
183 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1799  protein of unknown function DUF882  38.85 
 
 
187 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  34.55 
 
 
182 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  40.35 
 
 
190 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2874  protein of unknown function DUF882  40.17 
 
 
502 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  43.09 
 
 
526 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  41.03 
 
 
501 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  38.52 
 
 
182 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2751  hypothetical protein  40.17 
 
 
496 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  35.15 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  35.15 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  35.15 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  35.15 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  35.15 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  37.82 
 
 
625 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2978  protein of unknown function DUF882  40.17 
 
 
496 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  40.52 
 
 
169 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  42.61 
 
 
186 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  42.34 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  38.52 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  38.52 
 
 
182 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  41.03 
 
 
529 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  38.52 
 
 
182 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  43.43 
 
 
182 aa  85.9  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  40.68 
 
 
203 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  38.46 
 
 
184 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  41.67 
 
 
529 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  41.88 
 
 
589 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  41.67 
 
 
544 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  34.18 
 
 
182 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  39.13 
 
 
182 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  44.44 
 
 
163 aa  85.1  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  39.47 
 
 
229 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  38.79 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  39.64 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  40.68 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  32.92 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  37.93 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  41.67 
 
 
502 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  36.03 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  41.38 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  38.26 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  40.57 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  40 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  39.83 
 
 
187 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  41.41 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  39.82 
 
 
183 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  38.26 
 
 
190 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  37.58 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  38.6 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  40.52 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  38.66 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3192  protein of unknown function DUF882  38.53 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559007  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  48.68 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  37.07 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  33.9 
 
 
188 aa  72  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  36.21 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  35.96 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  36.21 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  34.48 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2869  hypothetical protein  39.02 
 
 
497 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>