110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3192 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3192  protein of unknown function DUF882  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559007  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  29.61 
 
 
189 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  38.89 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  36.15 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  36.15 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  36.15 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  36.15 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  36.15 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  29.61 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  36.92 
 
 
183 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3698  hypothetical protein  35.25 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.3093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  33.85 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  34.62 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  34.62 
 
 
186 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  35.66 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  32.09 
 
 
182 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  32.12 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  30.87 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  30.72 
 
 
229 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  34.17 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  32.09 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  29.53 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6865  hypothetical protein  33.58 
 
 
544 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  31.34 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  30.99 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  30.94 
 
 
659 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1222  hypothetical protein  34.33 
 
 
526 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  36.21 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  35 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  34.09 
 
 
529 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  31.34 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  33.33 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  33.09 
 
 
659 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  33.09 
 
 
637 aa  65.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  32.28 
 
 
452 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0990  hypothetical protein  35.07 
 
 
529 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  32.56 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  31.91 
 
 
636 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  29.85 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  32.5 
 
 
182 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  29.85 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  29.85 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3294  protein of unknown function DUF882  33.08 
 
 
597 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  32.56 
 
 
190 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3595  protein of unknown function DUF882  33.08 
 
 
598 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.733122  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  32.58 
 
 
589 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4669  protein of unknown function DUF882  33.61 
 
 
540 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.227252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  31.5 
 
 
458 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
183 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  33.08 
 
 
182 aa  62.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  34.17 
 
 
182 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  33.6 
 
 
502 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  29.86 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  31.82 
 
 
184 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  29.6 
 
 
625 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  30.25 
 
 
187 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  30.3 
 
 
541 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  32.56 
 
 
194 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  30.6 
 
 
195 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  29.29 
 
 
179 aa  59.3  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2682  hypothetical protein  29.5 
 
 
608 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1799  protein of unknown function DUF882  34.62 
 
 
187 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  26.67 
 
 
182 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  30.36 
 
 
183 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  29.29 
 
 
169 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  29.77 
 
 
203 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2806  hypothetical protein  30.22 
 
 
499 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.835595  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5363  hypothetical protein  29.28 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0595161 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  32.74 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  28 
 
 
188 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  31.4 
 
 
234 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  29.71 
 
 
459 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  32.46 
 
 
635 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  29.37 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  27.2 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  27.2 
 
 
188 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3151  hypothetical protein  26.15 
 
 
501 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.45 
 
 
195 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0216  protein of unknown function DUF882  25.38 
 
 
510 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.217337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  28.68 
 
 
186 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2874  protein of unknown function DUF882  28.69 
 
 
502 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>