56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1882 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  96.77 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  95.97 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  44.54 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  37.9 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  42.02 
 
 		 1050 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  41.27 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  36.63 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  33.33 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  35.59 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  34.38 
 
 		 347 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  52.63 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  33.33 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  36.28 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  34.65 
 
 		 421 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  38.78 
 
 		 459 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  38.78 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  32.35 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  42.17 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  31.2 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  31.2 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  37.04 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  28.1 
 
 		 355 aa  50.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  36.9 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  34.69 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  36.14 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  47.06 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  31.15 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  34.57 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  31.15 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  36.54 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  34.26 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  45.65 
 
 		 236 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.07 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  34.02 
 
 		 433 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  35.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  35.29 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  32.99 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  33.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  27.87 
 
 		 182 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  27.87 
 
 		 182 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  27.87 
 
 		 182 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  30.3 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  31.13 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  27.2 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  31.31 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  31.31 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  31.31 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  28.68 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  33.72 
 
 		 183 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  50 
 
 		 242 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>