92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0248 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  100 
 
 		 127 aa  269  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  41.13 
 
 		 224 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  48.31 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  35.9 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  40.48 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  39.2 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  41.27 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  35.45 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  33.64 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  33.64 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  33.64 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  36.63 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  32.11 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  32.11 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  34.68 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  35.19 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  35.19 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  33.33 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  31.31 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  31.91 
 
 		 347 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  33.33 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  41.89 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  35.64 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  31.31 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  30.61 
 
 		 426 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  30.43 
 
 		 356 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  35.42 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  29.9 
 
 		 421 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  31.31 
 
 		 183 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  32.32 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  32.32 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  32.94 
 
 		 459 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  37.18 
 
 		 194 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  31.31 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  33 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  32.32 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.32 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  38.55 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.32 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  32.32 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  35.44 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  30.3 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  37.89 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  32.32 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  33.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  33.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  33.71 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  48.72 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  36.36 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  31.31 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  37.1 
 
 		 236 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  33 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  26.26 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  33 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  31.31 
 
 		 625 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  33.61 
 
 		 1050 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  32.58 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  30.3 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  32.05 
 
 		 255 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  30.1 
 
 		 212 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  40.43 
 
 		 225 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  48.94 
 
 		 162 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4302  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.315098 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  43.18 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0545  hypothetical protein  42.31 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  23.88 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>