84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2254 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  100 
 
 		 80 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  72.22 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0545  hypothetical protein  60 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  41.33 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  41.33 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  42.86 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1217  twin-arginine translocation pathway signal  37.65 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  40.74 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  38.16 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  36.25 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  38.27 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  41.89 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  38.46 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  37.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  41.77 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  41.77 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1782  hypothetical protein  38.27 
 
 		 225 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.043222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  42.17 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  36.25 
 
 		 186 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  36.36 
 
 		 189 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  39.47 
 
 		 421 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  36.25 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  35.82 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  37.8 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1620  hypothetical protein  37.33 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0978634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  38.81 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  34.94 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  36 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  37.35 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  38.75 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.18 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  36.11 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 341 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  39.47 
 
 		 426 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  38.81 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1238  hypothetical protein  35.14 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0154317  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  42.47 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  37.68 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  32.91 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  33.73 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4302  hypothetical protein  35.62 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.315098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  38.81 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  35.14 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  39.29 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  36.99 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  40.91 
 
 		 459 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2663  protein of unknown function DUF882  34.78 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00451545  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  38.67 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  34.62 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  38.96 
 
 		 169 aa  43.9  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2892  hypothetical protein  32.71 
 
 		 312 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535809  hitchhiker  0.00714521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  32 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  29.7 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  31.33 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1328  putative membrane associated peptidase  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.632221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  36.49 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  37.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  37.33 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1575  hypothetical protein  37.68 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  0.176285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  36.23 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  36.99 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  43.59 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  35.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  35.29 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  36.23 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  32.81 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  43.4 
 
 		 1050 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  45 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  34.67 
 
 		 659 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  35.71 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  35.44 
 
 		 513 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>