27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1310 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  100 
 
 
132 aa  280  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  100 
 
 
132 aa  280  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  76.52 
 
 
132 aa  224  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  72.31 
 
 
133 aa  211  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  72.31 
 
 
130 aa  209  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  72.31 
 
 
130 aa  208  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  42.55 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  33.33 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  31.06 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  36.28 
 
 
224 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  36.05 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  32.11 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  32 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  31.2 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  31.2 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  31.19 
 
 
110 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  32.32 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  29.75 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  31 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  32.11 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  37.33 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  31.73 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  41.67 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  34.18 
 
 
255 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  27.27 
 
 
1050 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  27.84 
 
 
194 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  39.73 
 
 
179 aa  40  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>