18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01180 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  733    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2892  hypothetical protein  43.32 
 
 
312 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.535809  hitchhiker  0.00714521 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  28.1 
 
 
124 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  27.92 
 
 
124 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  27.92 
 
 
124 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  28.48 
 
 
129 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  31.13 
 
 
124 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  33.08 
 
 
234 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  27.78 
 
 
459 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  36.26 
 
 
146 aa  46.6  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  30.4 
 
 
146 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  32.58 
 
 
143 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  30.17 
 
 
151 aa  43.5  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  29.7 
 
 
80 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  37.36 
 
 
165 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  32.26 
 
 
426 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  31 
 
 
162 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>