57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3823 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  100 
 
 
124 aa  259  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  97.58 
 
 
124 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  95.97 
 
 
124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  44.54 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  37.9 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1152  Peptidase M15A  41.18 
 
 
1050 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000448461 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  39.2 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  35.59 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  36.63 
 
 
426 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  33.33 
 
 
110 aa  62  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  35.42 
 
 
347 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  34.38 
 
 
356 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  35.64 
 
 
421 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  39.8 
 
 
459 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  49.12 
 
 
102 aa  57  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 
341 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  43.84 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  34.13 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  32 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  32 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  32.84 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  37.04 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  41.77 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  36.17 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  27.92 
 
 
355 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  36.9 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  35.8 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  32.5 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  37.5 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  34.69 
 
 
433 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  34.69 
 
 
182 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  27.87 
 
 
513 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  31.15 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  47.83 
 
 
236 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  31.4 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  31.15 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  30.77 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  38.55 
 
 
194 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  35.29 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.71 
 
 
263 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  31.31 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  32.32 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  32.32 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  32.32 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  32.67 
 
 
234 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  31.53 
 
 
203 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  30.93 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  29.46 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  31 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  43.18 
 
 
246 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  33.05 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  39.19 
 
 
192 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0545  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  29 
 
 
163 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>