39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2064 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  100 
 
 
132 aa  280  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  93.08 
 
 
130 aa  258  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  91.54 
 
 
130 aa  253  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  90.77 
 
 
133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  76.52 
 
 
132 aa  224  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  76.52 
 
 
132 aa  224  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  38.94 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  35.45 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  33.64 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  33.05 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  36.27 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  32 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  28.7 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  30.3 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  30.3 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  33.67 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  32.43 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  30.77 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  30.28 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3189  protein of unknown function DUF882  32.04 
 
 
458 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  30.28 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0078  hypothetical protein  32.67 
 
 
659 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2932  protein of unknown function DUF882  34.95 
 
 
452 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0083  hypothetical protein  32.67 
 
 
637 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  27.84 
 
 
625 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  29.17 
 
 
212 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  28.28 
 
 
182 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  27.93 
 
 
186 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  32.32 
 
 
205 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  27.84 
 
 
195 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2732  hypothetical protein  31.25 
 
 
635 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830197  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4258  hypothetical protein  29.13 
 
 
636 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.374856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  35.44 
 
 
179 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  32.05 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2869  hypothetical protein  30.85 
 
 
497 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  30.21 
 
 
659 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>