23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1243 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1243  peptidase M15A  100 
 
 
130 aa  275  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.207822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2911  peptidase M15A  97.69 
 
 
133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2762  peptidase M15A  98.46 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31642  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2064  peptidase M15A  91.54 
 
 
132 aa  253  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.079322  normal  0.028661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1310  peptidase M15A  72.31 
 
 
132 aa  209  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.247553  normal  0.128784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2833  peptidase M15A  72.31 
 
 
132 aa  209  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.959813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  39.82 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  39.78 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  32.2 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  33.64 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  34.4 
 
 
117 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  35.29 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  33.03 
 
 
187 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  32.43 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  25.93 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  29.59 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2869  hypothetical protein  31.91 
 
 
497 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  30.28 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  31.19 
 
 
186 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  30.28 
 
 
190 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  27.84 
 
 
195 aa  40.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  35.44 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  32.05 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>