41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0545 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  60 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  58.33 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  48.08 
 
 		 182 aa  50.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1441  twin-arginine translocation pathway signal  48.08 
 
 		 183 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  46 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2110  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2394  protein of unknown function DUF882  46.15 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0868273  normal  0.0323721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  49.02 
 
 		 205 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1932  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1958  hypothetical protein  44 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1925  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1899  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1890  hypothetical protein  47.06 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2154  hypothetical protein  45.1 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00468929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1893  hypothetical protein  46.15 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  49.02 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1832  hypothetical protein  47.06 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.68574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2145  hypothetical protein  47.06 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  46 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1829  hypothetical protein  46.67 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  47.06 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  49.02 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1613  hypothetical protein  44.23 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  46 
 
 		 194 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1415  hypothetical protein  41.18 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.770208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  45.1 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1572  protein of unknown function DUF882  44 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  42 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  50.94 
 
 		 229 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1034  hypothetical protein  39.22 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  42 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  40.8  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2773  hypothetical protein  42 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  42.31 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  42 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  43.48 
 
 		 186 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  39.39 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  39.39 
 
 		 124 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2514  twin-arginine translocation pathway signal  44.23 
 
 		 187 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.465464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0028  hypothetical protein  42.22 
 
 		 186 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>