76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1742 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  100 
 
 
356 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  84.53 
 
 
347 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1451  peptidase M15A  51.57 
 
 
433 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  hitchhiker  0.00120403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1277  hypothetical protein  58.87 
 
 
426 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.174616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  58.06 
 
 
421 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  54.69 
 
 
459 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0028  Peptidase M15A  39.81 
 
 
142 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0040  Peptidase M15A  36.89 
 
 
142 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  34.65 
 
 
224 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  36.84 
 
 
124 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0149  hypothetical protein  35.71 
 
 
190 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.820879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3941  twin-arginine translocation pathway signal  36.52 
 
 
187 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  35.79 
 
 
124 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  39 
 
 
194 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2807  hypothetical protein  35.09 
 
 
229 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0027608  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  33 
 
 
129 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3814  twin-arginine translocation (TAT) pathway signal protein  34.45 
 
 
203 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0167  protein of unknown function DUF882  34.92 
 
 
190 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0042  protein of unknown function DUF882  35.45 
 
 
179 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.004948  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0056  hypothetical protein  34.95 
 
 
234 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2562  hypothetical protein  40.7 
 
 
182 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00126389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2653  hypothetical protein  40.7 
 
 
182 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.268193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1974  hypothetical protein  40.7 
 
 
182 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0878651  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1002  putative exported protein, Tat-dependent  33.65 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1029  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  33.65 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657191 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1094  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  33.65 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.664633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1111  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain/peptidase M15 family protein  33.65 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.402136  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1061  hypothetical protein  33.65 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755595 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5604  protein of unknown function DUF882  43.53 
 
 
212 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.0311514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3585  hypothetical protein  32.17 
 
 
186 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0796  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  38.96 
 
 
195 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.145099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02709  hypothetical protein  38.75 
 
 
195 aa  49.7  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2717  protein of unknown function DUF882  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2392  putative exported protein, Tat-dependent  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2194  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.908212  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2670  hypothetical protein  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0302417  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1087  putative exported protein, Tat-dependent  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00130799  normal  0.598369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00937  hypothetical protein  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.16592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1025  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0547598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1033  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00930  hypothetical protein  31.73 
 
 
182 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.132407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2053  protein of unknown function DUF882  33.64 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0538389  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  30.43 
 
 
127 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4190  protein of unknown function DUF882  30.09 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1781  hypothetical protein  32.71 
 
 
182 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00287342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1633  protein of unknown function DUF882  32.69 
 
 
182 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1445  hypothetical protein  31.73 
 
 
183 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485223  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5363  hypothetical protein  37.18 
 
 
234 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0595161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2156  protein of unknown function DUF882  30.56 
 
 
625 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2067  hypothetical protein  36 
 
 
502 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465944  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3448  hypothetical protein  31.4 
 
 
659 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.156424  normal  0.411175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0205  hypothetical protein  33.65 
 
 
186 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.187216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1727  hypothetical protein  31.73 
 
 
182 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.061203  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0380  hypothetical protein  35 
 
 
178 aa  46.2  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2591  protein of unknown function DUF882  32.46 
 
 
184 aa  46.2  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000549055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1614  hypothetical protein  34.04 
 
 
183 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0183846  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3688  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1661  protein of unknown function DUF882  32.71 
 
 
182 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0888  putative lipoprotein  36.25 
 
 
182 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  34.44 
 
 
146 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  41.51 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2144  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
185 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  42.86 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003128  hypothetical protein  39.24 
 
 
169 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000559341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0009  hypothetical protein  34.78 
 
 
205 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1073  hypothetical protein  28.07 
 
 
187 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  36.21 
 
 
143 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1427  hypothetical protein  36.46 
 
 
529 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2978  protein of unknown function DUF882  26.88 
 
 
496 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2751  hypothetical protein  26.88 
 
 
496 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3978  hypothetical protein  36.46 
 
 
541 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1034  hypothetical protein  34.62 
 
 
186 aa  43.5  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.874027  normal  0.457533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1751  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 
187 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.159115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1406  hypothetical protein  36.46 
 
 
589 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>