21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0235 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  31.65 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  42.37 
 
 
143 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  35.9 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  40.26 
 
 
149 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  35.71 
 
 
162 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  29.17 
 
 
513 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  48.89 
 
 
143 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  48.89 
 
 
143 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  48.89 
 
 
143 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
341 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  33.71 
 
 
459 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3197  hypothetical protein  42 
 
 
51 aa  45.4  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  29.2 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  39.39 
 
 
146 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  45 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.62 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1502  hypothetical protein  32.91 
 
 
182 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  32.32 
 
 
355 aa  42.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2450  hypothetical protein  33.77 
 
 
182 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00221503  normal  0.212903 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  32.05 
 
 
127 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>