30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3399 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  30.37 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  30.89 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  29.58 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  30.71 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  30.23 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  27.82 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  30.66 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  25.36 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  25.95 
 
 		 187 aa  52.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  27.52 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  28.46 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  21.37 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  26.77 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  27.84 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28.46 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  27.1 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  27.91 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  26.92 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  25.4 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  42.59 
 
 		 445 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0893  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.68 
 
 		 430 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.412419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.35 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  31.01 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  31.01 
 
 		 184 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  39.62 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2249  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 183 aa  42.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 214 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>