34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1155 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  384  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  41.23 
 
 
188 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  31.69 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  35.56 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  36.81 
 
 
205 aa  88.6  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  35.85 
 
 
186 aa  87.8  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  33.73 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  34.62 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  29.73 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  35.14 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  33.87 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  32.37 
 
 
342 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  30.28 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  39.77 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  32.48 
 
 
276 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  30.97 
 
 
308 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  30.25 
 
 
313 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  27.62 
 
 
260 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  29.55 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  29.55 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28.17 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  30.95 
 
 
265 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  28.17 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.84 
 
 
251 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  30.77 
 
 
313 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  27.08 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  29.41 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  21.47 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  22.53 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  21.47 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  21.47 
 
 
210 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  24.14 
 
 
209 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>