27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0368 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  319  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  38.52 
 
 
186 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  42.03 
 
 
187 aa  97.1  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  31.69 
 
 
185 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  40.29 
 
 
205 aa  91.7  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  37.6 
 
 
188 aa  87.8  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  38.76 
 
 
342 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  42.45 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  43.88 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  32.79 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  43.38 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  36.8 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  35.94 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  31.08 
 
 
205 aa  67  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  31.47 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.89 
 
 
251 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  35.19 
 
 
210 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  30.84 
 
 
260 aa  58.2  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  36.08 
 
 
313 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  32.08 
 
 
191 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  27.78 
 
 
265 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  32.03 
 
 
313 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  36.36 
 
 
276 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3875  dihydrouridine synthase DuS  28.16 
 
 
384 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0179624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  23.89 
 
 
208 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>