47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1608 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  34.2 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  31.79 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  32.82 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  31.43 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  33.61 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  31.37 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  30.36 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  31.39 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  34.69 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  32.52 
 
 
308 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  34.69 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  33.87 
 
 
313 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  32.58 
 
 
313 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  27.75 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  29.6 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  30.95 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  29.2 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  27.75 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  29.86 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  33.03 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  28.89 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  30.65 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  30.84 
 
 
276 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  27.61 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  27.57 
 
 
210 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  24.84 
 
 
198 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  28.33 
 
 
191 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  26.36 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  23.12 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  23.2 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  26.49 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  26.49 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  26.27 
 
 
265 aa  48.5  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  25.95 
 
 
210 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.84 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  25.69 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  22.64 
 
 
210 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  22.64 
 
 
210 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  22.64 
 
 
210 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  22.64 
 
 
210 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  26.56 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  25.2 
 
 
258 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  26.72 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  25.71 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  25.34 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  20.15 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>