34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2373 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  353  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  97.28 
 
 
190 aa  317  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  63.93 
 
 
205 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  38.73 
 
 
186 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  44.08 
 
 
187 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  32.97 
 
 
194 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  37.74 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  41.5 
 
 
342 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  33.14 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  39.52 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  38.4 
 
 
254 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  34.69 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  38.14 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  35.9 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  37.27 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  34.75 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  38.64 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  34.43 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  32.81 
 
 
276 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  29.25 
 
 
260 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  30.16 
 
 
265 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  27.52 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  26.35 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  26.17 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  25.64 
 
 
222 aa  51.2  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  31.74 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.01 
 
 
251 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  25.24 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  30.08 
 
 
210 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  30.39 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  28.16 
 
 
214 aa  45.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  25.41 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  26.47 
 
 
209 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>