40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1469 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  100 
 
 		 214 aa  445  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  44.88 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  43.41 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  43.84 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  49.38 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  44.64 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  48.3 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  36.51 
 
 		 246 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  31.05 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  29.5 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  27.96 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  27.96 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  27.49 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  30.91 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  26.54 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  26.54 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  26.54 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  26.07 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  26.54 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  24.64 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  31.97 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  26.67 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  31.76 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  30.49 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  26.85 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  29.27 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1300  hypothetical protein  33.63 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  22.78 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  29.46 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  26.89 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  25.34 
 
 		 313 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  25.9 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  25.69 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  25.29 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  21.97 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  22.06 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  30.97 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0953  hypothetical protein  27.08 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000058701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>