34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1729 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  100 
 
 		 276 aa  557  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  66.81 
 
 		 313 aa  321  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  54.14 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  54.19 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  33.56 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  29.17 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  30.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28.78 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  33.96 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  29.81 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  28.36 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  34.35 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  31.36 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  32.88 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  32.48 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  28.44 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  32.81 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  25.86 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  30.41 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  25.23 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  30.17 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  28.57 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  30.84 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  31.25 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  26.05 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.03 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  29.17 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>