36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3401 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  381  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  34.71 
 
 
194 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  34.53 
 
 
186 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  34.38 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  37.1 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  32.85 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  38.18 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  36.72 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  37.41 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  35.94 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  35 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  33.33 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  32.53 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  32.73 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  37.27 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  32.17 
 
 
265 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  32.37 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  30.16 
 
 
313 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  30.91 
 
 
260 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  33.86 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  39.77 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  31.2 
 
 
313 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0949  hypothetical protein  24.42 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  27.18 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  27.13 
 
 
222 aa  48.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  26.8 
 
 
208 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.85 
 
 
251 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  29.69 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  26.18 
 
 
211 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  30.97 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  26.73 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  26.36 
 
 
208 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  28.83 
 
 
210 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  29.91 
 
 
246 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  26.73 
 
 
254 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>