25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0113 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  55.88 
 
 		 265 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  56.55 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  48.5 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  32.89 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  28.77 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  30.71 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  32.37 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  33.07 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  34.75 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  32.2 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  29.75 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  29.55 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  24.24 
 
 		 254 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  32.08 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  26.49 
 
 		 313 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.65 
 
 		 251 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  28.33 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  25.83 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  25.83 
 
 		 308 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  30.19 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  29.37 
 
 		 313 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  28.93 
 
 		 276 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  26.19 
 
 		 260 aa  41.2  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>