24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0947 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  47.78 
 
 
194 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  52.7 
 
 
191 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  41.67 
 
 
265 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  31.4 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  31.86 
 
 
342 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  29.66 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  27.5 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  30.28 
 
 
194 aa  62.4  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  27.97 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  25.4 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.67 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  27.61 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  27.7 
 
 
308 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  25.89 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  30.36 
 
 
260 aa  45.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  30.61 
 
 
313 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  26.73 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  24.54 
 
 
313 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  28.07 
 
 
190 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>