35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1820 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1820  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000198777  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2213  hypothetical protein  59.32 
 
 
186 aa  218  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.267822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  50.34 
 
 
205 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  39.1 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2886  hypothetical protein  40.11 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  39.26 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2373  hypothetical protein  44.08 
 
 
184 aa  109  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1607  hypothetical protein  32.09 
 
 
194 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0368  hypothetical protein  42.03 
 
 
161 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278582  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  31.93 
 
 
342 aa  89  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1921  hypothetical protein  35.56 
 
 
308 aa  87.8  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  34.16 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1155  hypothetical protein  34.62 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2398  hypothetical protein  32 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00182976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2213  hypothetical protein  35.46 
 
 
265 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2212  hypothetical protein  33.05 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  35.97 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  27.33 
 
 
313 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0113  hypothetical protein  29.85 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0852347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  25.86 
 
 
276 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  23.24 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  22.65 
 
 
212 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  22.1 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  31.73 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.95 
 
 
251 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  22.78 
 
 
222 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  24.69 
 
 
210 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  26.72 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  24.07 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  23.46 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  22.84 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  25.64 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  24.58 
 
 
208 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>